纳西族信仰东巴教、藏传佛教等宗教。
　　丽江纳西族还普遍信奉“三朵”神，成为多种信仰的民族。

　　纳西族普遍信奉东巴教(永宁又称“达巴”)，是一种受藏族铭教(黑教)影响的原始巫教，崇奉多神，山水风火等自然现象均视为神灵，非病死者及冤家仇人则视为恶鬼，凡遇疾病、婚丧、节日等都要请东巴念经。东巴没有寺庙，一股都是不脱产的农民。东巴教始祖名为丁巴什罗，东巴经书中有一类经书叫《什罗超荐经》，记载了他的生平和故事；在中甸自地和丽江南山汝南化村，有两个大山洞相传为“什罗修行洞”，过去东巴教徒都要前去朝圣。纳西族还信奉“桑多”为至尊的本主神灵，据《光绪丽江府志》记载：“南调封为北巍，元世祖征大理时经此，救封为大圣北额定国安邦景帝。”北撅庙在丽江白抄玉龙山麓，纳西语称“桑多阁”，古相参天，一进三院，旧时每年二、八月的羊日，不分宫民都前去献牲祈福，香火之盛，无与伦比，民间还有许多有关“白沙桑多”的动人传说。

　　纳西族地区又是佛教(禅宗)和喇嘛教(密宗)交汇的地方，红教喇嘛寺从藏区往南传到丽江为止，掸宗和尚庙由内地往北传也到丽江为止，所以纳西族也信佛教和喇嘛教，还有信道教的，形成了信仰多种宗教的民族，但信而又不全信，有病有钱就信，无病无钱就不信，解放以后，群众对宗教的信仰破渐淡薄。